Najczęściej papier pakowy wykorzystuje się do owijania różnego rodzaju paczek. W ten sposób można je skutecznie zabezpieczyć między innymi przed wszelkiego rodzaju zanieczyszczeniami, a także ciekawskim wzrokiem niepowołanych osób. Jest to szczególnie ważne, kiedy pakunek zawiera wartościowe przedmioty, a na kartonie widnieje nadruk jednoznacznie identyfikujący jego zawartość.
 
Papier pakowy sprawdza się również w zastosowaniach przemysłowych i magazynowych, gdzie używany jest na przykład w charakterze przekładki pomiędzy warstwami towaru składowanego na regałach i paletach oraz wypełniania luk w opakowaniach zbiorczych.
 
Chętnie wykorzystują papier pakowy także lakiernicy (na przykład w warsztatach samochodowych) oraz ekipy remontowo-budowlane, które zabezpieczają nim rozmaite powierzchnie przed zachlapaniem farbą czy tynkiem lub zarysowaniem.